Index

B

bval (difit.workflows.bin.config.Input attribute)

bvec (difit.workflows.bin.config.Input attribute)

C

crashfile_format (difit.workflows.bin.config.Nipype attribute)

D

difit module difit.client module difit.client.parser module difit.client.run module difit.workflows module difit.workflows.bin module difit.workflows.bin.config module

difit.workflows.dki module difit.workflows.dti module difit.workflows.inputnode module dki_b0_images (difit.workflows.bin.config.Moptions attribute) dki_b_values (difit.workflows.bin.config.Moptions attribute) dki_wf() (in module difit.workflows.dki) dti_b0_images (difit.workflows.bin.config.Moptions attribute) dti_b_values (difit.workflows.bin.config.Moptions attribute) dti_wf() (in module difit.workflows.dti) dwi (difit.workflows.bin.config.Input attribute)

G

get_linked_libs (difit.workflows.bin.config.Nipype attribute)

get_plugin() (difit.workflows.bin.config.Nipype class method)

I

init() (difit.workflows.bin.config.Input class method) (difit.workflows.bin.config.Nipype class method) (difit.workflows.bin.config.Output class method)

Input (class in difit.workflows.bin.config) input (difit.workflows.bin.config.Input attribute) inputfiles() (in module difit.workflows.inputnode)

L

loader() (in module difit.workflows.bin.config)

log_dir (difit.workflows.bin.config.Output attribute) logdir (difit.workflows.bin.config.Output attribute)

M

main() (in module difit.client.run) mask (difit.workflows.bin.config.Input attribute) memory_gb (difit.workflows.bin.config.Nipype attribute) models (difit.workflows.bin.config.Moptions attribute) module difit difit.client difit.client.parser difit.client.run difit.workflows difit.workflows.bin difit.workflows.bin.config difit.workflows.dki difit.workflows.dti difit.workflows.inputnode

Moptions (class in difit.workflows.bin.config)

N

Nipype (class in difit.workflows.bin.config)

nprocs (difit.workflows.bin.config.Nipype attribute)

O

omp_threads (difit.workflows.bin.config.Nipype attribute) outdir (difit.workflows.bin.config.Output attribute)

Output (class in difit.workflows.bin.config) output_dir (difit.workflows.bin.config.Output attribute)

P

parse_args() (in module difit.client.parser)

plugin (difit.workflows.bin.config.Nipype attribute) plugin_args (difit.workflows.bin.config.Nipype attribute)

R

read_saved_config() (in module difit.workflows.bin.config)

resource_monitor (difit.workflows.bin.config.Nipype attribute)

S

save_config() (in module difit.workflows.bin.config)

scoupsettings() (in module difit.workflows.bin.config) stop_on_first_crash (difit.workflows.bin.config.Nipype attribute)

T

totoml() (in module difit.workflows.bin.config)

W

work_dir (difit.workflows.bin.config.Output attribute)

workdir (difit.workflows.bin.config.Output attribute)